凝胶色谱是以多孔凝胶为固定相，利用凝胶孔的空间尺寸效应，使不同大小的分子达到分离的一种高效液相色谱（HPLC）方法。其分离机理类似于分子筛效应，大体积分子只能渗入少量大孔，在固定相中所经历的路径较短，先流出。所有孔隙都不能进入的大体积分子，不被保留，在死体积处流出。因此，溶质按分子体积从大到小依次流出色谱柱。在凝胶色谱中，流动相只起溶解样品的作用，以有机溶剂为流动相的凝胶渗透色谱（GPC）应用较多，而以水为流动相的凝胶过滤色谱的应用相对较少，这主要是因为水溶性大分子不仅可以溶于水，通常也能溶于有机溶剂中。甲苯和二甲基甲酰胺等非极性有机溶剂是常用的流动相。在凝胶色谱中，固定相表面与溶质分子间不存在化学相互作用，即固定相是惰性多孔材料。
gpc凝胶净化是凝胶渗透色谱主要应用的一种，是样品前处理的一种方法。
gpc凝胶净化是一种以惰性多孔凝胶为固定相，基于尺寸排阻原理，主要依据分子尺寸大小差异使物质分离的一种高效液相色谱方法。
gpc凝胶净化的分离原理：
一个含有各种分子的样品溶液缓慢地流经凝胶色谱柱时，各分子在柱内同时进行着两种不同的运动：垂直向下的移动和无定向的扩散运动。
大分子物质由于直径较大，不易进入凝胶颗粒的微孔，而只能分布颗粒之间，所以在洗脱时向下移动的速度较快。
小分子物质除了可在凝胶颗粒间隙中扩散外，还可以进入凝胶颗粒的微孔中，即进入凝胶相内，在向下移动的过程中，从一个凝胶内扩散到颗粒间隙后再进入另一凝胶颗粒，如此不断地进入和扩散，小分子物质的下移速度落后于大分子物质，从而使样品中分子大的先流出色谱柱，中等分子的后流出，分子小的后流出。
